Ich würde dir AntiBot empfehlen, da viele Proxies von Webseiten gescraped werden. NoCheatPlus bringt nicht so viel, da es nur die Joins blockiert ab einem bestimmten Limit. Dieses Limit kann auch von vielen Spambot-Programmen übernommen werden. Zwar joinen immer noch Bots, aber diesmal nicht so viele. AntiBot blockt aber alle, welche einen Proxie zum einloggen benutzen. Dies könnte zwar negativ für Server mit BungeeCord sein, aber man kann ja ganz einfach eine Whitelist mit erlaubten Proxies einrichten. Proxies sind in Minecraft eig nicht vorgesehen und werden auch sehr sehr selten (mir ist keiner bewusst) von normalen Spielern benutzt. NoCheatPlus und/oder Auth-Plugins, dieses nur das einmalige registrieren von einer IP erlaubt, können trotzdem einen Server bis zu seinem Absturtz in die Kniee bringen.
Weepcraft ist nur ein HackClient, doch es gibt auch reichlich externe Programme, welche einen SpamBot Angriff ermöglichen. So solltest du es etwas allgemeiner definieren.